[hackmeeting] codigo abierto y bacterias

[EwS]

Vale, lo del agua computa me recuerda muchisimo a la parte del 
Ciptonomicon en la que Waterhouse abuelo esta caminando sobre la orilla 
del mar, que con sus pisadas modifica y se pregunta si en la orilla 
contraria Rudy v. Hackleber no estara identificando sus movimientos 
computando las oscilaciones milimétricas de la orilla....

Es curioso lo que dices, tiene mas de filosofía que de ciencia 
computacional 'pura', supongo que habras leido 'Permutation City' de G. 
Egan... :) Ten en cuenta una cosa, que, según dices, computar = 
intercambio de información, no es un calculo-Turing o una operación 
Turing computable.... o sea, el agua puede ser producto de una 
computación T-compatible (vale, simulado por un macroordenador, a lo 
13th Floor), pero de por si no tiene porque ser un ente con capacidad 
computacional (un ente vivo computacionalmente), es decir, es un 
'producto', no es algo que generaría nuevas computaciones o que en 
principio pueda ser aprovechado para computar ¿no?

(si no es asi hazmelo saber, me encanta el tema)...

Ahora bien, en la computacion de ADN por ejemplo buscamos un 'algo' 
(computar el dilema del prisionero por ejemplo), y tenemos uns medios 
para acercarnos a ese algo (función de peso, como en los GA, eliminando 
entes que no se nos acerquen a la solución o simplemente definiendo 
reglas que harán que mueran por si solos), esas mismas reglas podemos 
aprovecharlas en una red bacteriana (o en una simulación de red 
bacteriana, claro, no me imagino como 'matar bacterias' asi por las 
buenas), no estamos hablando de sistemas equivalentes?

Por cierto, gracias mil por el applet :)


Luther Blisset wrote:
> 
>>
>> Chulísimo. Deberías tenerlo colgado por ahí (en el mismo wiki como 
>> dicen en otra respuesta....
> 
> 
> gracias. vaya! parece ser que el articulo ha gustado. deberia escribir 
> mas a menudo ;)
> 
> 
>> Una idea para ampliarlo (si aceptas sugerencias claro) sería pensar si 
>> una red bacteriana podría considerarse como Turing computable y por lo 
>> tanto capaz de computacion universal (tu texto así lo sugiere),
> 
> 
> la idea es un poco a la inversa.
> es decir, que no es que se considere que una red bacteriana es capaz de 
> computacion universal, sino que habiendose demostrado que un CA(automata 
> celular) es capaz de computacion universal, y partiendo de la hipotesis 
> de que "la naturaleza computa", podria obtenerse una equivalencia entre 
> el automata y los procesos de computacion que teoricamente llevarian a 
> cabo las bacterias. Si lo planteamos a la inversa, la respuesta es 
> sencilla: no podemos saber si las bacterias son capaces de computacion 
> universal, ya que seria un poco dificil convencerlas para que llevaran a 
> cabo todo tipo de computaciones a nuestro antojo ;)
> 
> me explico con mas detalle...
> 
> Esos fascinantes universos llamados CA(automatas celulares) pueden 
> utilizarse como una maquina virtual de proceso masivamente paralelo y 
> distribuido, que realiza computaciones a traves de objetos como los 
> gliders(deslizadores) que chochan entre si y cosas asi. Es decir, es 
> como un ordenador de proceso paralelo y distribuido simulado dentro de 
> un universo virtual, que es el automata. un ordenador dentro de nuestro 
> ordenador.
> por cierto, conozco un buen ejemplo de un applet on-line y soporta todo 
> tipo de automatas, lo he probado con el konqueror de mi debian y con 
> otras plataformas y funciona muy bien, aunque es un poco lento. ademas 
> te lo puedes bajar off-line y canviar los archivos de reglas, etc.. y 
> hay disponible el codigo fuente del applet por si alguien le quiere 
> echar un vistazo:
> 
> http://www.mirwoj.opus.chelm.pl/ca/mjcell/mjcell.html
> 
> bien.. sigo. habiendose demostrado que un CA puede llevar a cabo 
> cualquier tipo de computacion en los terminos de una Maquina de Turing 
> Universal, entonces podemos esperar que pueda ser equivalente a 
> cualquier proceso basado en computaciones.
> 
> Existe la hipotesis de que todo en la naturaleza seria 
> computacion(incluidos nosotros), de forma que si me siento en la orilla 
> del rio que pasa por mi ciudad(uhmm.. que bien ;) y observo el devenir 
> del agua, esa agua se esta computando. Cuando una bacteria le pasa un 
> gen a otra, se esta computando. yo mismo o nosotros nos estamos 
> computando leyendo este mail.
> aunque esa hipotesis no fuera cierta, sin duda es interesante observar 
> el mundo desde esta perspectiva. eso nos permite por ejemplo, darnos 
> cuenta que existe un paralelismo en los universos masivamente paralelos 
> y distribuidos de los CA y los de las bacterias.
> observamos los procesos de las bacterias como procesos de computacion y 
> los intentamos modelar informaticamente utilizando CA. Aunque 
> modestamente creo que los CA por si solos no bastan para modelar las 
> redes bacterianas, necesitamos integrar programacion evolutiva dentro de 
> los CA. De hecho las implementaciones inspiradas en las redes 
> bacterianas, se han llevado a cabo basicamente a nivel de algoritmos 
> geneticos(un algoritmo genetico dicho muy sucintamente es un algoritmo 
> de busqueda basado en principios de teoria de la evolucion). de hecho de 
> momento tiene mas sentido seguir modelando utilizando programacion 
> evolutiva, pero me parece fascinante esta via de investigacion, 
> relacionada con la "naturaleza que computa".
> 
> espero haber aclarado un poco el asunto :)
> 
> saludos,
> 
> Luther
> 
> 
> 
> 
> 
> 
> 
> 


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Juan Pablo Puerta - EwS ~en~ Hispamp3 ~punto~ com - JID: ews en jabber.sk
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"All animals are created equal, but some are more equal than others"
					George Orwell, Animal Farm